肛泰栓以及马应龙痔疮膏两种药物的治疗效果都是差不多的，它们都经过了临床的实践治疗，所以对于肛肠疾病来说有着比较不错的效果。这两种药物的成分是有差别的，包括在治疗的时候所着重的方面也不太一样，因此不能够用来比较哪一个效果好。
对于马应龙痔疮膏这种药膏，有着活血、消肿以及清热、燥湿的功效，对于肛裂以及痔疮的情况有着不错的疗效。至于肛泰，可以起到清热、解毒、消肿、止痛以及凉血、止血的效果。所以对于止血和凉血这方面功效比较独特，因此两种药物各有各的优势和用处，在选择的时候要根据患者的病情来对待，在医生的指导下来使用。