九价疫苗三针需要间隔一段时间进行注射，间隔的时间是让药物充分发挥其作用，因为每一针的功效有所差异，充足的时间能够使接种者产生抗体。第一针和第二针疫苗注射被称为致敏疫苗，接种后产生抗体，第二针所产生的抗体是第一针的几十倍，抗体作用时间大大延长，第三针注射为增强免疫力，能够使产生抗体的效价更高，预防效果更加持久。
由于机体受到抗原性物质的刺激，产生抗体的时间在2-3周左右。因此，疫苗作用的时间需有一定的间隔，能够在预防HPV病毒中起到最大的作用，建议于女性有性生活史前注射九价HPV疫苗，能够很好的预防宫颈癌等疾病的发生。