胃蛋白酶原1和胃蛋白酶原2偏低，考虑胃黏膜分泌功能下降。胃蛋白酶原主要由胃黏膜主细胞分泌，经胃酸刺激后形成胃蛋白酶后促进食物的消化、吸收。根据生化性质和免疫原性主要分胃蛋白酶原1和胃蛋白酶原2两种。胃蛋白酶原1主要由胃底腺的主细胞分泌，胃蛋白酶原2主要除由胃底腺外的主细胞分泌之外，贲门腺及幽门腺也可分泌。所以胃蛋白酶原数值的测定反应不同部位胃黏膜的分泌水平。胃蛋白酶原1和2偏低，提示胃黏膜分泌水平较下降，胃黏膜萎缩程度较重。随着萎缩程度的加重，可能会导致胃黏膜肠化，增加胃癌发生的危险，因此胃蛋白酶原1和胃蛋白酶原2是检测胃黏膜萎缩及预测胃癌风险较好的一项检查。