手术治疗主要用于强直性脊柱炎患者晚期，出现了明显的脊柱侧弯、驼背畸形、髋关节畸形，以及影响活动的跟骨骨刺等，可以通过手术治疗达到改善生活质量的目的。一般认为，该病有一定自限性，部分患者在一定阶段可以自行缓解。
但是如果强直性脊柱炎早期出现脊柱受累、活动受限、髋关节受累，幼年发病，有阳性家族史，C反应蛋白、血沉等炎症指标居高不下，常提示预后不佳，可能会出现关节强直畸形甚至功能障碍。
建议患者及时在专业医生的指导下服用控制病情活动的药物，如柳氮磺吡啶、甲氨蝶呤等，也可以使用生物制剂来控制病情。