再生障碍性贫血患儿的生存时间，主要取决于再生障碍性贫血的类型、治疗手段，以及治疗效果。因为再生障碍性贫血是血液系统造血功能衰竭性疾病，分为非重型再生障碍性贫血和重型再生障碍性贫血。对于非重型再生障碍性贫血，也称为慢性再障，如果经过雄性激素以及环孢素的治疗，患者可以长期生存。如果治疗效果不佳，需要依靠反复输血的患者，生存期就比较短。如果是彻底治愈，需要积极寻找合适的供体，尽早进行造血干细胞移植。
对于重型再生障碍性贫血，首选同胞相合异基因造血干细胞移植治疗，移植后大多数孩子可以长期生存，不能移植的患者可用抗胸腺球蛋白，还有环孢素、免疫抑制剂的治疗，治疗有效率也可以达到80%左右。免疫抑制剂治疗起效比较慢，治疗期间也需要强度的输血支持、抗感染支持治疗。对于重型再障患者在接受积极治疗的情况下，部分可以治愈。对再生障碍性贫血的生存期有个体差异，取决于疾病分型、是否治疗，以及与治疗的手段有关。