滴虫阴道炎的治疗是需要进行抗滴虫的治疗，主要治疗药物为硝基咪唑的药物，也是可以使用甲硝唑的。但是具体的用药以及用药的剂量要在医生的指导下进行使用，进行滴虫的治疗可以选择局部用药，也可以选择全身用药。
但是因为滴虫阴道炎患者可同时存在尿道、尿道旁腺、前庭大腺多部位的滴虫感染，所以对于滴虫性阴道炎的治疗比较建议进行全身的用药，并且要避免阴道的冲洗。由于滴虫阴道炎是由性行为传播的，性伴侣应该同时的进行治疗，这一点是比较重要的。并且要告知患者及性伴侣，治愈前应避免无保护性行为。