胃食管反流病是胃内容物反流到食管乃至咽喉、气道造成的一系列症状和并发症，胃食管反流反流到食管就会引起食管黏膜的腐蚀，形成食管炎。引起胃食管反流，通常是由于贲门永久性松弛，或者一个叫食管裂孔疝的解剖学问题而造成的。
胃镜的检查对于胃食管反流是非常重要的，通过胃镜可以看到患者是否因为胃食管反流而造成了食管炎，通过食管炎的严重程度可以评估胃食管反流是否严重，另外通过胃镜可以评估贲门的形态是否出现问题，是否出现了贲门松弛或出现了食管裂孔疝，因为贲门松弛和食管裂孔疝是引起胃食管反流的根本原因，是它的解剖学基础，通过胃镜就可以把这两点看得非常清楚，这是胃镜对胃食管反流评估的意义。
除了对胃食管反流进行一个评估，胃镜还可以用于排除其他疾病，可以看到患者的黏膜是不是出现由于长期胃食管反流而造成巴雷特食管，或者出现一些癌变的迹象。胃镜还可以用来评估患者是否有食管溃疡、有没有胃炎等等，来进一步排除一些其他问题，因为有一些食管和胃的问题也可以有类似于胃食管反流的症状，胃镜就可以比较全面的去评估胃食管反流。