衢州医院排行靠前的有衢州市人民医院、衢州市中医院、衢州市第三医院等。衢州市人民医院是一所三级甲等综合性医院，是本地区及闽、赣、皖边际区域集医、教、研、防为一体的大型现代化、智能化、花园式医院，医院先后获得了全国卫生文明建设先进集体、全国医药卫生系统先进集体等荣誉。衢州市中医院是国家级非物质文化遗产“杨继洲针灸”和市级非物质文化遗产“雷氏医学”的传承与保护单位，现已成为集医疗、教学、科研、康复养生、预防保健为一体的衢州地区唯一一家综合性三甲中医院。