肇庆医院无绝对排名，较好的有肇庆市第一人民医院、肇庆市中医院、中山大学附属第三医院肇庆医院等。 肇庆市第一人民医院是肇庆地区规模最大的综合性国家三甲医院，现已跨入爱婴医院、省教学医院的行列；医院科室齐备，专科各具特色，新生儿科、骨科、高血压、糖尿病等多个特色专科在省内、市内都保持着较强的优势。 肇庆市中医院是集治未病、医、教、研、康、养生养老为一体的地市级综合性中医院，拥有肾病科、脾胃病科、骨伤科、脑病（中风）科、针灸推拿康复科等多个国家级、省级中医重点专科，是广东省中医名院创建单位。 中山大学附属第三医院肇庆医院由中山三院垂直纵向延伸管理，将委属委管医院的“国家队”优质医疗资源带进肇庆，引进的新技术中近一半为肇庆地区首次开展，带动提升了粤西地区医疗服务水平，满足了地区群众就近享有高水平医疗服务需求。