全国比较好的小儿神经内科医院有复旦大学附属儿科医院、首都医科大学附属北京儿童医院、重庆医科大学附属儿童医院等。这三家医院的神经内科分别位居复旦版《2021年度中国医院专科声誉排行榜》第1、2、3名。 复旦大学附属儿科医院神经内科包括神经科病房、神经专科门诊、神经脑电生理监测工作站等，医疗水平与学科建设在临床服务、科研教学、人才培养等方面不断发展，成为具有鲜明专科特色、高质量临床与转化研究水平和坚实梯队结构的小儿神经专业队伍。 首都医科大学附属北京儿童医院神经内科是我国小儿神经内科的发源地之一，该科门诊病人多、病源广、疑难杂症集中，承担各种神经内科危重症、疑难病、神经内科疾病以及癫痫术后恢复病人的诊治和护理，技术力量雄厚。 重庆医科大学附属儿童医院神经内科是我国最早成立的小儿神经专科之一，集医、教、研为一体，是重庆医科大学附属儿童医院重点学科。现由神经专科病房、专科门诊、儿童癫痫诊治中心、临床神经电生理室、神经病学研究室5部分组成，是西部地区儿童神经疾病诊治中心。