重庆市排名前五的医院推荐陆军军医大学第一附属医院、重庆医科大学附属第一医院、重庆医科大学附属儿童医院等。 陆军军医大学第一附属医院位居复旦版《2021年度中国医院综合排行榜》排名29，专科病理科、烧伤科、整形外科、康复医学等均进入了复旦版《2021年度中国医院专科声誉排行榜》前十，拥有国家重点学科12个，国家临床重点专科军队建设项目12个，军队医学专科中心14个。 重庆医科大学附属第一医院位居复旦版《2021年度中国医院综合排行榜》排名48，拥有国家卫健委“国家临床重点专科建设项目”18个（产科、检验科、重症医学、专科护理、内分泌科、心血管内科、胸外科、神经外科、麻醉科、神经内科、普通外科、眼科、呼吸内科、耳鼻咽喉科、肿瘤科、医学影像科、老年病科、骨科），重庆市医疗质量控制中心20个，综合诊断治疗水平居国内先进行列。 重庆医科大学附属儿童医院位居复旦版《2021年度中国医院综合排行榜》排名61，小儿内科、小儿外科均进入了复旦版《2021年度中国医院专科声誉排行榜》前十，连续12年进入中国医院百强榜。