甲亢用同位素治疗安全，从1942年第一例放射性核素碘-131治疗甲亢以来，有效性和安全性就得到了充分的证实。大量的临床试验表明甲亢用同位素治疗之后，甲状腺癌和白血病等癌症的发病率没有看见明显增加，遗传损害或者基因异常的发生率也和普通人没有差别。因甲亢导致不孕不育或者性功能障碍的患者用碘-131治疗之后，随着甲亢的控制，生育能力和性功能也会得到明显改善，临床上的例子有很多。
碘-131治疗之后也有一定的危险，最主要的危险要预防甲亢危象的发生，虽然发生率特别低，但是一旦发生，死亡率很高。甲亢危象应该以预防为主，在碘-131治疗前就用抗甲状腺的药物治疗4-6周，等甲状腺功能恢复或者症状消退以后逐渐减量，治疗前2-3天之后停用。治疗之后也可以继续用抗甲状腺药物控制治疗，以保证碘-131围治疗期的安全。
