宫颈糜烂为宫颈柱状上皮异位，一般为生理性改变，与宫颈癌疫苗无关。如果宫颈柱状上皮异位合并宫颈炎，反复刺激可增加宫颈癌概率。因机体存在炎症，抵抗力下降，因此容易合并HPV感染并导致宫颈癌。从预防宫颈癌角度讲，疫苗可预防HPV感染。若仅为宫颈柱状上皮异位，不影响注射宫颈癌疫苗。

若患者已感染HPV，注射疫苗意义不大。如HPV16、18均已呈现阳性，打二价疫苗完全没有意义，因疫苗作用于蛋白，感染过人群蛋白外壳已经脱落，DNA已整合至体内DNA内，因此疫苗对已经感染过的患者无效。