肝囊肿术后的并发症主要包括以下几种：
1、出血：肝切除、单纯肝囊肿切除、囊肿开窗及囊肿引流术后均可发生出血。出血部位主要是肝断面、肝脏与囊肿剥离面、囊壁边缘；
2、胆瘘：肝切除断面、囊肿剥离面、囊肿内壁均可产生胆瘘；
3、感染：包括囊肿腔内感染及切口感染；
4、肝功能不全：对于多囊肝晚期患者及巨大肝囊肿，经肝叶切除、囊肿切除及开窗手术后均可能导致肝功能不全；
5、肝囊肿复发：孤立性肝囊肿治疗效果较好，术后极少复发，多发性肝囊肿术后较容易复发，但是大部分肝脏手术预后良好，很少出现严重并发症。
预防肝囊肿术后出现各种并发症，患者需要到正规医院进行诊断治疗，这样才能更有保障。除此以外患者术后需要听从医生建议，及时复诊，确保正常休息和规律饮食。