根管治疗后细菌的感染主要原因如下：
1、选择的充填材料不密合，比如使用临时性材料或者玻璃离子类的材料，材料与冠方贴合不佳，容易导致口腔细菌进入；
2、做根管治疗的时候如果根管里面没有清理干净，细菌就会在根管里存留，没有使用热牙胶，而是使用各种各样的冷牙胶去充填，导致根管里面有很多空隙，而且根尖孔又没有封闭好，没有达到完美的封闭，所以感染的另一原因是冠方封闭不好和根方封闭不好；
3、根管治疗过程中根管内炎症控制不佳也是导致根管治疗以后感染的重要原因之一。根管治疗后感染的症状主要是疼痛，包括整个牙齿松动，可能还会出现根管、牙根的瘘管，后牙的咬合痛等，都是根管治疗后感染所致。