甲功5项主要是筛查甲状腺功能，以便诊断是甲状腺功能亢进，还是甲状腺功能减退。对于甲功5项，通常检查的指标是促甲状腺激素(TSH)和血清总甲状腺素(TT4)、血清游离甲状腺素(FT4)、总三碘甲状腺原氨酸(TT3)、游离三碘甲状腺原氨酸(FT3)。

甲功5项如果TSH减低，T3、T4、FT3、FT4升高，考虑为甲状腺功能亢进症。如果促甲状腺激素(TSH)升高，游离三碘甲状腺原氨酸(FT3)、血清游离甲状腺素(FT4)、总三碘甲状腺原氨酸(TT3)、血清总甲状腺素(TT4)减低，则提示甲状腺功能减退。因此甲功5项是诊断甲状腺功能亢进、甲状腺功能减退的重要指标之一，但还需要其它的辅助检查明确诊断。