卵巢囊肿3cm不建议怀孕。如果是初次发现卵巢囊肿，虽然囊肿不大，建议进行观察，如观察2-3个月。卵巢囊肿有生理性囊肿和病理性囊肿，生理性囊肿经过2-3个月观察会自然消退，不需要进行治疗。在临床上比较多见的如黄体囊肿、滤泡囊肿，所以建议不要发现囊肿后备孕、怀孕。

如果经过观察以后，囊肿不消退反而会增大，这时要考虑是卵巢的新生肿物，可以进行肿瘤标志物的筛查。当确定是卵巢的新生物以后，还是应该先手术、再怀孕。如果怀孕以后肿瘤增大，再考虑手术就非常麻烦，最大的风险就是增加手术难度，而且容易引起来流产。所以不要发现卵巢有囊肿以后立即去怀孕，要明确诊断再进行怀孕。