通常吻合器钉在1个月左右可以自行脱落，多数在快脱落时拔除不疼。由于部分患者吻合器钉会长在皮肤内，当发现吻合器钉残留在阴茎皮肤内侧时，应当采用局部麻醉手术的方式取出。通常拔钉时需要切开皮肤寻找，然后用血管钳将钉取出，麻醉取钉时不疼，但在取钉前后会出现明显不适症状。
部分患者吻合器钉脱落时间较长，可能长期戴在包皮表面，可导致包皮局部疼痛，触摸时可出现局部小硬块改变，进行CT检查时可以发现吻合口处存在吻合器钉残留。目前进行包皮环切手术吻合器时，部分患者要求进行无钉手术，可以减少术后吻合器钉脱落的问题，手术后用可吸收肠线将吻合口缝合，通常不需要拆线，吻合可以较快恢复。
