急性胃肠炎病因不同，预后也不同。一般而言，少数病毒性感染引起的肠炎可以自愈。但多数胃肠炎由于细菌或者霉菌感染引起，通常不能自愈。部分患者还可能会逐渐加重，进而引起感染性休克，以及体内水电解质平衡紊乱，甚至引起死亡等严重后果。如果发生急性胃肠炎，需要及时到医院就诊治疗。

急性胃肠炎病因包括病毒感染，如小儿腹泻，往往是轮状病毒感染所致。若胃肠炎同时合并感冒，则胃肠炎往往与引起感冒的病毒有关，包括细菌感染，比如大肠杆菌、沙门氏菌等。此外，还有霉菌感染和理化因素，如进食生冷食物等原因，都可以引起急性胃肠炎。