甲胎蛋白是常用的肝癌肿瘤标记物，但甲胎蛋白仅在60%-70%的肝癌患者中升高，有30%-40%的肝癌患者甲胎蛋白完全正常，因此不是所有的肝癌甲胎蛋白都高。但有些情况也会出现甲胎蛋白升高，比如活动性肝炎、肝硬化、肝功能失代偿期，肝硬化也属于活动期，会出现甲胎蛋白的升高，因此甲胎蛋白不是判断肝癌晚期的唯一标准。

对于肝癌，患者要通过影像学的诊断，生化、理化学检查诊断，可以得出临床诊断。肝癌晚期的患者可能不能手术，或肝功能不好不能耐受手术，除手术之外，目前还有介入治疗、射频消融、微波消融、靶向治疗、免疫治疗等方法，可以帮助肝癌晚期患者提高生活质量，提高生存周期。