临床上输尿管炎很少单独发生，通常是肾盂肾炎和肾周围感染的一部分，所以临床表现和肾盂肾炎以及膀胱炎等临床表现类似，主要的临床表现为排尿的刺激症状，患者可能会存在尿频、尿急、尿痛。其次患者会出现肉眼血尿，如果存在梗阻引起积水，会出现腰部疼痛症状，如果感染比较重，可能会出现发热等全身症状。影像学检查对输尿管炎的诊断有一定帮助，尤其是急性炎症，波及到输尿管，引起穿孔、尿液外渗时，通过影像学检查可以明确诊断。
对于非特异性的输尿管炎，它的临床表现和泌尿系统其他部位感染类似，还有一些特异性的感染，包括输尿管的结核、血吸虫性的输尿管炎，它们的临床表现各有各的不同。临床上最常见的是非特异性的输尿管炎，通常要进行病因治疗，应用抗生素处理，如果有梗阻，可以行相应的引流治疗，甚至考虑行外科手术治疗。
