针刺麻醉的主要穴位为合谷穴、内关穴、足三里穴、背俞穴、夹脊穴、合穴、原穴、络穴等，不同的手术用的穴位不一样，如甲状腺、乳腺、剖腹产的穴位选择不同。穴位的选择主要与部位有关，相应的神经节段的穴位选择会较多，而且选择的穴位与神经节段有密切的重叠性效果会更加理想。

现在针麻使用较少，主要原因是针麻虽然可以减少麻药用量，但不能完全取代麻醉药品。手术过程中进行针麻，很多情况下不能特别稳定地麻醉，患者在手术过程中可能会有不适感，疼痛过于剧烈会影响手术，患者感受欠佳。现在追求舒适感，整个手术过程最好能在无痛、患者不能感知的情况下进行，可以增加手术的舒适感并减轻恐惧感。