恶性骨肉瘤病因目前尚无明确结论，可能原因如下：

1、青少年骨头发育过程中，可能产生基因突变，导致出现肿瘤细胞。同时由于部分儿童免疫功能存在缺陷，导致肿瘤细胞形成后无法被人体免疫功能及时发现和清除；

2、部分成年人骨头本身有病变或骨头经照射产生基因突变，从而形成骨肉瘤。此种骨肉瘤是在原有病的基础上进一步发生恶变，所以恶性程度很高。