小孩房间隔缺损5mm是否能自愈，取决于小孩的年龄，若是1岁以下的小孩，则可能自愈，若是3岁以上的小孩，则不能自愈，具体如下：

1、可能自愈：若小孩比较小，比如1岁以下，此时小孩的房间隔缺损5mm可以再观察，一直观察到1岁，甚至可以观察到3岁。若1岁的时候变成4mm，2岁的时候3mm，到3岁时已经长上，则此类情况最幸运。因此，小孩年龄越小，家长就越可以等；

2、较难自愈：若小孩超过3岁，则需要积极干预，因为小孩过了3岁，此时5mm的房间隔缺损长上去的可能性不是太大。一般5mm的房间隔缺损，可能更多的是二孔中央型的房间隔缺损。此时可采用微创的方式进行治疗，所以若小孩超过3岁，但房间隔缺损没长上去，需告诉小孩和家属，此小孩需要做微创手术。

因此，小孩房间隔缺损5mm，年龄越小，如几个月，甚至不到1岁，此时可以等一等，等到2岁甚至3岁，此时小孩的房间隔缺损可能自愈。但若房间隔缺损越等越大，则不要犹豫，此时要及时就诊并采取相关治疗方式干预。