咽炎不会影响核酸检测，因为核酸检测是通过获取呼吸道的标本，检测呼吸道标本中含有病毒的特异性病原体及特异性基因序列来发现病原体。不管咽炎是何种病原体感染所引起，在检测时均有目标病原体，如做新型冠状病毒核酸的检测，仅观察标本中有无新型冠状病毒特异性的基因序列存在，其他感染性的病原体不会影响标本中目标病原体的检测，故咽炎不会影响核酸检测。

不管咽炎类型为慢性、急性或非特异性、感染性，在获取呼吸道标本时，均是在咽部获取呼吸道标本。但在取核酸咽拭子标本前，注意不要咀嚼口香糖，因咀嚼口香糖可使咽部局部的内环境发生改变，导致获取的呼吸道标本质量下降，可影响核酸检测的结果。