新生儿手指根部发黑的原因一个是寒冷引起，另一个是缺氧引起，具体如下：

1、寒冷：刚出生的新生儿从母体到自然环境中，可能温度有偏差，可以出现寒冷的表现，手指根部可以出现发青、发黑。有发烧的时候、血液循环不佳的时候，也会出现手指发青、发黑，保暖后就可以缓解，不用过于紧张；

2、缺氧：重要的是持续的手指根部发青、发黑，就要考虑有没有心肺疾病，比如肺部疾病导致缺氧，会引起呼吸加快，肺炎或者肺发育不良的新生儿会出现青紫。还有心脏疾病的新生儿会出现青紫、发黑，比如先天性心脏病，有些极重的心肌炎都可以引起持续性手指根部发黑、青紫，都要及时去医院就诊，确定诊断。