扁平疣出现色素沉着，一般是治疗以后出现色素沉着，如果通过扁平疣自愈，或者用中药内服或者外洗，一般不会出现色素沉着。自愈是皮疹会消退。扁平疣不要过度紧张，可以自愈。因为扁平疣属于中医疣子或者千日疮范畴。千日疮在古代外科起源中指疣，生于千日自消，即3年会自愈。一旦患者自愈脱落以后，没有痕迹。患者用中药内服，或者提高免疫力，增强抵抗力，像转移因子、胸腺肽内服，内治消退，不会出现色素沉着。
患者出现色素沉着，最常见的是用激光或者冷冻治疗以后出现色素沉着，不要过度紧张。一般患者通过自己恢复或者药物治疗可以痊愈。首先患者要注意色素沉着时，或者激光冷冻治疗以后，不要去过度暴晒，要注意防晒。患者可以口服增白、减少色素的药物，最常用的药物是维生素C。维C可增白，或者吃含维C丰富的食物，最常见的苹果、西红柿。另外，患者局部可以用褪色素药物，最常用的像氢醌霜。
所以患者出现色素不要过度紧张，要注意防晒，可以吃含维C多的食物，或者直接吃维C药物，外用减轻色素的增白药物，像氢醌霜。