男性出现尿道疼痛的原因不同，治疗方法也不同，具体如下：
1、急性尿道炎、急性膀胱炎：患有这两类疾病，建议患者口服头孢、磷酶素或喹诺酮类消炎药，可以迅速对泌尿系统的感染菌群起到杀灭作用。除药物治疗之外，建议患者每日饮水量保持在2000-3000ml。通过多饮水促进排尿，以达到冲刷尿道、保持泌尿系统相对清洁的目的，并且可以显著遏制泌尿系统病原微生物的增殖速度；
2、淋菌性尿道炎：患者会出现尿频、尿急的症状，治疗主要以静脉输液为主，常用药物包括青霉素、氨基糖苷类抗生素及喹诺酮类消炎药。停药时间主要取决于尿道流脓、排尿刺激症状是否消失，以及尿常规检测结果是否恢复正常。
