男性尿道疼痛最主要原因是尿道感染，尿路感染通常是逆行感染，从尿道口进去的细菌、其它病原体造成的感染。针对尿道疼痛可以到医院进行尿常规检查，如果发现尿液中白细胞增加可以诊断为泌尿系感染、尿道炎。

最主要的是细菌感染，常见是大肠杆菌，除此之外包括衣原体、支原体以及淋球菌都会造成尿道感染，也会出现尿道刺痛、刺痒症状。所以出现这些症状后建议到医院就诊，首先查尿常规，明确是否有感染存在。通过尿培养化验了解具体是哪种病原体造成的感染，选择合适的药物进行相应治疗。