肾脏移植后会发生排异，分不同时期。从移植肾植入患者体内，血流开放，一直到伴随患者终生，均可能发生排斥。但目前从治疗药物角度而言，控制效果较好，能够有效避免绝大多数的急性排斥反应。

当然，部分患者可能存在慢性排斥反应，包括肾脏慢性失去功能的情况。但是目前肾脏移植手术排异的发生率较低，因为有非常充分的预防手段，包括比较好的术前配型等，均可使肾脏移植达到较低的排斥率。但并非所有患者均不会发生排斥反应，发生后也有非常有效地治疗手段。