普通气管镜在呼吸系统疾病中运用非常广泛，是非常常规的检查，也是呼吸科医生需要掌握的比较常见、常规的技术。普通气管镜主要是确定腔内病变，如各级气管、各级支气管腔内，若有病变，可以直接取组织。另外配合超声，如EBAS超声检查，可以去除气管周围淋巴结及管腔外病灶，所以运用非常广泛。

除此之外，取到患者病变组织活检后，可以送病理检查、送组织培养，确定患者病变性质，即是良性或恶性，可以进行肿瘤分期，可以培养病原菌，明确有无肿瘤、结核、真菌等相关病变。