小脚趾甲有两瓣时，去除方法如下：

1、甲床缝隙：如果仅是趾甲下两甲床之间的缝隙，外观上像两半，这时可通过手术将甲床部位去除一半，留一个即可；

2、六趾畸形：如果是因为底下有两根骨头，即六趾畸形，第六趾没长出来，在脚趾里分为两根。这时一般要采取手术治疗，将外侧小脚趾骨及对应甲床部分全都切掉，缝合皮肤即可。

如果趾甲两瓣并不影响功能，同时也没有带来疼痛、肿胀、化脓、流血等症状，只需将指甲前端矫齐即可。如果甲床中间的缝外观上不好看，可在修甲过程中将指甲打磨平整，使甲缝模糊一点。