阴囊B超主要检测的器官包括精索、精索静脉、睾丸、附睾、鞘膜等，因此对于常见疾病，阴囊B超检查能够进行初步诊断。阴囊常见疾病包括附睾炎、睾丸炎、附睾囊肿、睾丸囊肿、睾丸肿瘤、精索静脉曲张等，通常在超声影像下易区分。但阴囊彩超并不能够分辨所有疾病，例如少见疾病，有时要配合血液学检查，还要配合临床症状、病史以及其他影像学，如CT、核磁、核素等检查，才能得到明确诊断结论。
对于囊性肿物，阴囊B超检查可以看到液性暗区，而发生鞘膜积液时可以看到明显睾丸外大量积液。通常精索静脉曲张，可以看到精索静脉迂曲、扩张，增加腹压时有静脉反流。睾丸肿瘤可以看到实性结节，内部血供比较丰富。发生炎症时虽然是实性结节，但血液分布与肿瘤不同。
