膜性肾病在临床分中为两种，若是有先行原因引起的膜性肾病，即继发性膜性肾病的原因没有解除，如肿瘤还存在或引起肾脏病的药物仍然在服用，即使针对膜性肾病进行治疗，比如治疗6个月，可能仍不会得到较好的效果。而继发性膜性肾病指继发于自身免疫性疾病、感染性疾病、肿瘤性疾病或药物引起的膜性肾病，而剩余不明原因的膜性肾病则称为原发性膜性肾病。

即使是原发性膜性肾病，目前中高危患者建议用激素或免疫抑制剂进行治疗，但每种治疗方案也并不是100%见效，针对不同病人可能需选择不同的方案。可以使用激素加环磷酰胺、钙调磷酸酶抑制剂、利妥昔单抗中的一种。而如果治疗6个月不见好转，也可以选择其他方案。此外，膜性肾病常见的并发症即深静脉血栓形成，尤其是肾静脉血栓形成，也会影响治疗的疗效。