慢性肠胃炎并没有特异性非常强的治疗药物，主要根据患者的症状进行对症治疗，具体有以下几种：
1、反酸：此时可服用质子泵抑制剂，如奥美拉唑(奥美拉唑肠溶胶囊)、雷贝拉唑(雷贝拉唑钠肠溶片)；
2、萎缩性胃炎伴有肠化：此时需服用较弱的抑酸药物如法莫替丁，以及黏膜保护剂；
3、腹痛、腹泻：患者主要是以腹部的症状为主，比如有腹痛、腹泻，可服用肠道钙离子拮抗剂如匹维溴铵，肠道菌群调节剂如双歧三联(双歧杆菌乳杆菌三联活菌片)、双歧四联(双歧杆菌四联活菌片)等药物。
慢性胃肠炎时一定要做相关检查，排除肿瘤性、占位性等比较凶险的疾病，如果45岁及以上，在给患者诊断为慢性胃肠炎时，建议做胃镜、肠镜排除消化性溃疡、胃癌、反流性食管炎以及溃疡性结肠炎等相对比较急重的疾病，再服用对症药物治疗。
