打完HPV疫苗第二天来月经不会影响疫苗的效果，因为HPV疫苗是通过注射减毒的HPV，然后刺激机体产生对HPV的抗体，从而达到预防宫颈癌的目的。HPV抗体的产生与机体接受的HPV疫苗有关，与月经来潮是没有关系的。注射完HPV疫苗，机体的免疫系统开始行动，产生对HPV的抗体，从而可以预防HPV的感染。通过预防HPV的感染来预防宫颈癌，达到有效的制约和控制HPV感染的作用。
HPV疫苗是目前来讲可以预防宫颈癌最有效的方法，所以适龄的女性都应该注射HPV疫苗，可以减少宫颈癌的发生。但是注射完HPV疫苗以后仍不能掉以轻心，仍需进行宫颈癌的筛查，避免其他类型的HPV感染，导致宫颈癌的发生。
