脑干出血最好的结果是无后遗症，但此种情况较少见。若出血为针尖样大小的微出血灶，则神经系统损伤较小，无任何症状。

因为脑干是纤维非常密集的地方，大脑半球与脑干体积较小，含有中脑、桥脑和延髓，所有此处纤维非常密集，上、下行的传导束都从此经过。12对颅神经的核团都位于脑干，所以任何的脑干出血和损伤可能都会导致较严重的后果。