耳朵和头一阵一阵的疼有可能是以下几种情况：

1、急性中耳炎：当身体抵抗力下降时，细菌、病毒侵犯到上呼吸道，出现耳膜炎症、耳膜充血，这时出现急性中耳炎会出现耳朵疼痛，并且可以放射到头部，引起一阵一症的疼痛；

2、外耳道炎症：如果经常掏耳朵，挖耳勺伤到外耳道壁，可以引起外耳道的疼痛。外耳道疼痛也可以放射到头部，引起头部一阵一阵的疼痛；

3、神经病变：当同侧的神经出现病变的时候，比如舌咽神经或者是由于三叉神经出现病变。那么可以引起同侧的耳朵以及头部有一阵一阵的疼，神经疼会出现疼痛比较难忍的情况。

所以出现以上几种情况的时候，需要做耳内镜的检查。如果是由于中耳炎或者外耳道炎引起的疼痛，首先保持耳道的干燥、清洁，同时口服抗生素，一般经过一周的抗感染治疗可以控制症状。

如果是由于神经疼引起耳朵和头部疼痛，需要到神经内科做进一步的治疗。