新生儿心率低的主要原因如下：

1、围产期因素：属于较常见原因，可能是围生期缺氧或缺血，如母亲是高危孕妇或合并妊娠高危因素，包括妊娠期糖尿病、妊娠期高血压，分娩时羊水过多或过少，宫内缺氧而导致；

2、心律失常：如窦性心动过缓、房室传导阻滞、房早未下传，也可引起新生儿心率低，需要通过心电图明确病因；

3、先天性疾病：如低血糖、甲状腺功能不全、先天性甲状腺功能减退、先天性遗传代谢病，均可以引起新生儿心率低，建议查明病因。