不孕不育针灸部位主要根据每个人不同情况而定，因为每个人症状表现出来不一样，病因不一样、病机不一样，所以取穴会考虑全身性取穴，或者局部腹部、腰部取穴治疗。造成不孕症患者的原因，比如跟工作压力、环境、夫妻之间关系、跟父母亲关系等，所以本身产生症状也较复杂，比如有些患者失眠表现较多，有些患者会表现胸闷、消化不良方面。还有些患者会有其它症状，比如腰痛、腹痛等，症状不一样取穴也是不一样，治疗也不一样，主要通过全身调理，把内分泌系统、全身脏腑组织、器官调理好，达到阴阳平衡的状态。

针灸的部位，可以取头部穴位，比如患者有失眠，可以取头部神庭、四神聪等穴位，还有些肩膀上穴位，比如患者有颈椎病，或者其它肩膀疼等疾病，可以取风池、肩井、天宗穴位。如果月经之前有乳房胀痛、乳头痛等，还可以取膻中、期门等疏肝理气。最重要的穴位是腹部穴位，腹部可以取气海、关元、中极、子宫、归来等，上述穴位主要可以调节月经不调，或者月经量少、月经时腹痛等。有些患者会伴有腰酸、腰疼等，可以取腰部穴位，比如肾俞、次髎、大肠俞等。还可以取大腿、小腿穴位，比如阴廉、足三里、三阴交等穴位，关键是全身治疗，取穴是全身上面、下面，一般四肢都可以取。