NCCN指南认为亚肺叶切除术的适应症，主要包括肺功能比较差或者其它严重合并症导致不能耐受进行肺叶切除、位于肺实质外侧1/3及病变直径＜2cm的周围性早期肺癌，包括原位癌和微浸润癌。

我国专家对于亚肺叶切除的适应症按照良性和恶性分为两大部分。良性病变只局限于某一个肺段的良性肿瘤，例如支气管扩张症、结核球、肺囊肿、炎性假瘤、硬化性血管瘤、肺曲霉菌感染等。恶性肿瘤包括心肺功能差，不能耐受肺叶切除、术中需要切除便于进一步进行病理诊断、肺内多发病变，需要同时切除的患者。患者如果需要将来再次手术，也可以考虑行亚肺叶切除。另外，直径＜2cm的部分早期非小细胞肺癌是绝对的亚肺叶切除的手术适应症，尤其是对于CT上观测到的直径＜1cm的肺部磨玻璃病灶，采用解剖型肺段切除术，结合术中快速病理检查后得出术后治疗效果，5年生存期可以达到100%。