治疗肝胆管结石主要采取以手术为主的综合治疗。手术治疗的目的是尽量取净结石，解除胆道梗阻和狭窄，消除肝内感染性的病灶，从而使胆汁的排出畅通。肝胆管结石手术方式即为胆管切开取石，解除胆管远端狭窄后做胆肠吻合术与肝脏切除术。目前这些手术方式都非常成熟，手术的成功率基本可以达到99%以上，这些手术的风险也随着手术技术的提高逐渐地降低，比如以前肝脏切除要大开刀，现在随着腹腔镜技术的成熟，新的大量的能量平台的应用，腹腔镜下切肝非常便捷。另外以前止血的工具，都是缝线、结扎，现在有很多电器械，包括超声刀或者电钩，都能达到很好的止血效果，从而降低了手术的风险，安全系数大大提高。