在绝经后，子宫腺肌症的病灶由于激素水平下降，通常能逐渐萎缩，即自愈。子宫腺肌症的原因尚不清楚，主要考虑遗传因素、子宫腔损伤。
遗传因素即母亲有腺肌症，可能女儿有腺肌症的机会更大，并非100%遗传，但发生几率更大。子宫腔遭受不同程度的损伤亦可出现此现象，如反复人流，反复宫腔操作促使子宫内膜进入肌层，同时还保持一定活性，随着激素水平的波动可出血，血液淤积在子宫肌层内，可影响肌层的弹性，引起局限性的增厚、增大，进而发生子宫腺肌症。
子宫腺肌症与激素水平息息相关，绝经后激素水平可下降，雌激素、孕激素均处于比较低的水平。子宫肌层内异常的内膜亦不会随着月经周期中激素水平的波动而波动，可造成子宫腺肌症病灶缓慢萎缩，年龄较大后，萎缩通常较明显。
针对这种情况，临床上有一种治疗方法，即未绝经的患者可用药物造成短时间的绝经，亦可明显缓解子宫腺肌症的症状，缩小病灶，利于怀孕。
