月经后尿道疼痛，通常是尿路感染所致。女性经期时用护垫，如果清洁卫生不到位，可能使尿道外口细菌进到尿道内，形成尿路感染。尿路感染主要临床表现是尿道疼痛，出现尿痛，甚至伴有尿急、尿频症状。

确诊方法是到医院查晨尿，留取晨起空腹时的中段尿，化验尿常规，如果尿常规中白细胞数增多，一般诊断为尿路感染。出现尿路感染后，可用抗生素，如喹诺酮类抗生素等，针对泌尿系统和肠道感染的窄谱抗生素进行治疗。还可用清热利湿、通淋的中药，尤其是中成药进行治疗，通过中西医结合的综合性治疗，较快会得到缓解和痊愈。