如果恶性纵隔肿瘤已经无法手术，即进入中晚期，或者肿瘤与心脏和大血管关系尤其紧密，都会增加手术风险。总之，无法进行手术治疗的患者，一般存活率不会超过五年。部分患者甚至可能在一年之内甚至几个月内就会死亡。另外，存活时间与个体的机体免疫力以及治疗的敏感性有关。通常不能手术的纵隔肿瘤患者，可能需做化疗、内分泌治疗，或者放疗以及免疫治疗，甚至中医的药物治疗。患者对药物治疗的敏感性，以及对放射性药物治疗的耐受性，也是决定其生存的重要因素。如果机体的免疫力较高，对治疗的敏感性也较好，同时又能耐受化疗或者放疗的患者，存活时间可能相对较长。
