头孢菌素是临床治疗感染性疾病最为常用的抗生素之一，在应用当中可能会发生一系列的超敏反应，轻度的像皮肤潮红、荨麻疹，到危及生命的过敏性休克。有研究表明，对一种头孢菌素过敏的患者，大约有37%会对其它头孢菌素也会产生反应。对一种头孢菌素过敏的患者应该避免使用其它头孢菌素，可以选用其它种类的抗菌药物，比如克林霉素，它是在围手术期患者不能够使用头孢菌素时的首选药物。根据临床治疗的需要，还可以选择红霉素类抗生素，比如阿奇霉素、克拉霉素等，沙星类当中的左氧氟沙星、莫西沙星，四环素类当中的多西环素、米诺环素，都是头孢菌素过敏的可替代选择。有些对头孢菌素过敏的患者也有可能对上述替代药物过敏，临床应用可替代药物的时候也应该密切观察，一旦发生过敏反应需要及时停药，做好抢救措施以免发生意外。
