精子形态分析主要检查精子形态是否符合标准，比如是否存在畸形率偏高，因观察时较为正常精子，通过标准检查可以发现形态异常精子，大部分精子中，形态异常精子占多数。目前精子形态标准主要＜96%精子畸形率，属于正常标准，即正常形态精子需要＞4%才符合标准。

精子形态分析主要测精子是否存在畸形率，比如精子形态包括头部畸形、尾部畸形、体部畸形，通常在畸形率分析报告中会有所体现，也属于精子检测常规指标。

除常规精子浓度外，还包括精子活率、精子形态等，异常精子形态偏高时也会影响受孕概率，从而影响到精子活动能力以及受孕能力。精子形态分析对备孕以及优生优育来讲，属于较为重要的指标，主要排查畸形精子比例。