漱口水属于牙周炎辅助用药，故对牙周炎治疗具有辅助作用，主要用于预防和减少牙菌斑发生。漱口水具有抗菌作用，可以消除或者是减少口腔内微生物，防止细菌在牙面和牙周袋内繁殖，防止炎症发生。但漱口水在口腔内停留时间较短，进入龈下深度小于1mm，所以其作用有限。

对于牙周炎药物治疗，通常在用药之前均需先清除牙周菌斑与牙石，去除局部刺激因素，然后再辅以口服或漱口水等局部药物。目前临床上漱口水品种较多，如洗必泰、氯己定、替硝唑等，均对牙周炎有一定控制作用。