通常无需因为无创DNA检测低风险，而进行有创操作，如羊水穿刺等。无创DNA检测没问题指无创DNA检测低风险，需与患者解释检测报告，低风险不等于没风险，只不过意味部分疾病发生风险较低。

无创DNA检测不可替代其它检查，如B超等，所以患者还需结合超声筛查，可做胎儿全身筛查，包括脑室等脑组织结构发育，以及肾脏的输尿管、肾盂，肠道等部位的超声筛查，此外还有心脏筛查。若出现超声筛查的异常表现，称为超声软指标，必要时需行羊水穿刺，如发生室间隔缺损或脑室轻度增宽等情况时。