肛周脓肿术后24小时内，手术创面可能增加因大便摩擦而出现急性出血的风险，因此如果没有强烈便意，则建议患者24小时后再进行排便。但如果在24小时内，患者有强烈的便意，通常自然排便即可。多数情况不会造成严重问题，通常比较安全，不会造成待干预的情况发生。

因为肛周脓肿是感染创面，因此大便接触到创面时，不会出现再次感染的问题。而创面切开后不予以缝合，是为达到引流肛周脓肿脓液的目的。而肛周脓肿创面是否能如期愈合，或肛周脓肿手术后是否复发，多数情况与排便无绝对关系。